Etiopatogeneesi määratletakse kui patoloogia või ebanormaalse seisundi põhjuste ja arengu analüüsi. Mõiste tuleneb "etioloogia" ja "patogeneesi" ühendusest, mis meditsiinivaldkonnas näitavad vastavalt põhjuslikke tegureid (etioloogia) ning patoloogilise protsessi (patogenees) alguse ja sellest tuleneva arengu mehhanism.
Etiopatogenees võib olla kindel (täpselt määratav), multifaktoriaalne (tingitud erinevatest teguritest), ebakindel, tundmatu või valesti mõistetud. Enamik levinumaid haigusi tunneb ära "multifaktoriaalse etiopatogeneesi", kuna päritolu ja areng on sageli tingitud geneetiliste tegurite koosmõjust ( tundlikkus, pärilikkus, väikesed mutatsioonid jne) väga olulise keskkonnakomponendiga (toitumine, füüsiline aktiivsus, kehakaal, suitsetamisharjumus, stress, alkoholi tarbimine, narkootikumid, mitmesugused kuritarvitused jne). Nende käitumuslike tegurite tähtsust erinevate haiguste etiopatogeneesis rõhutab asjaolu, et nende ekspressioon homosügootsetes kaksikutes (seega sama geneetilise pärandiga) võib samuti oluliselt erineda.